Thérapie génique, analyse génique… Où en est la médecine génomique ?

La médecine génomique : déjà une réalité 

L’évolution de la connaissance du génome suscite donc beaucoup d’espoir pour le futur de la médecine. Aujourd’hui, cela se traduit déjà par des avancées très concrètes. Et le principe des analyses génomiques sont déjà utilisées :

• pour optimiser les traitements de patients atteints d’un cancer
• pour effectuer des dépistages opportunistes, c’est-à-dire étendre le champ de certains tests spécifiques à d’autres finalités, et ce grâce à l’analyse des variations génétiques
• pour certains tests effectués avant une grossesse
• pour le dépistage prénatal et néonatal (voir ci-dessous)…

Le diagnostic prénatal non invasif (NIPT), qu’est-ce que c’est ? 

Le diagnostic prénatal non invasif, ou NIPT, est l’un des tests qui se base sur l’analyse génétique. Il est effectué chez la femme enceinte pour détecter le risque de trisomies 21, 18 et 13. Le test s’effectue en  analysant l’ADN du fœtus qui circule dans le sang de la mère. 

La valeur ajoutée de cette méthode de test ? Elle est beaucoup moins invasive que les tests effectués précédemment et qui nécessitaient une ponction du liquide amniotique dans l’utérus, avec à la clé un risque de fausse couche. Les résultats sont par ailleurs beaucoup plus fiables et plus rapides.

 L’assurance obligatoire de la sécurité sociale prend en charge une partie du coût de ce test. Partenamut rembourse en outre jusqu’à 150 euros des frais restant à la charge du patient après le remboursement de l’INAMI. 

La thérapie génique : qu’est-ce que c’est ? 

La thérapie génique se base sur la découverte des gènes monogéniques à la base des maladies héréditaires. L’idée initiale de la thérapie génique ? Réparer ce gène défectueux. Pour y arriver, un médicament vecteur contenant l’ADN ‘réparé’ est envoyé vers le noyau des cellules visées par la thérapie, de manière à ce que la protéine qui n’est pas produite à cause de l’anomalie génétique puisse être produite. 

Ces découvertes se sont traduites à la fin du siècle dernier et au début des années 2000 par des recherches et essais cliniques ciblant principalement des syndromes d’immunodéficience. Les premiers résultats ont été encourageants, avec notamment le retour de l’immunité chez des bébés-bulles. Mais des effets secondaires graves, à savoir l’apparition de la leucémie, sont ensuite apparus. Malgré ces premiers résultats finalement décevants, la recherche a continué à avancer. Le champ s’est élargi et cible désormais d’autres maladies que les pathologies héréditaires monogéniques. Par exemple le cancer, des affections cardiovasculaires ou encore l’hémophilie. 

Comment fonctionne la thérapie génique ?

Le médicament vecteur va selon les cas agir de différentes manières, notamment :

• en effectuant le travail de production de la protéine que le gène malade ne peut plus assumer. Des médicaments de ce type sont déjà présents sur le marché et ciblent notamment des maladies de l’immunité.
• en réparant une mutation génétique ou en éliminant le gène muté. Le médicament contient d’une part une enzyme qui va découper la partie problématique du génome, et d’autre part une partie d’ADN qui va la remplacer. C’est ce qu’on appelle l’édition génomique. De nombreux essais et expérimentations sont en cours, grâce notamment aux perspectives ouvertes par les techniques des ciseaux génétiques CRISPR-Cas9, dont le principe est expliqué dans cette vidéo.
• en stimulant la production par la cellule d’une version modifiée de la protéine qu’elle n’arrive pas à générer. 
• en mixant thérapie cellulaire et thérapie génique. L’objectif ? Créer de nouvelles cellules avec de nouvelles armes thérapeutiques, qui pourront par exemple reconnaître des cellules cancéreuses et les éliminer.

Selon les cas, ces thérapies géniques s’effectuent… 

• in vivo, c’est-à-dire en agissant directement dans la cellule et dans l’organisme du patient,
• ou ex vivo, c’est-à-dire  en prélevant les cellules, en les modifiant en laboratoire et en les réinjectant ensuite dans le corps.

De la recherche à la thérapie génique : où en est-on aujourd’hui ? 

Les avancées récentes de la recherche en thérapie génique ont dans certains cas franchi les portes des laboratoires, avec la mise sur le marché de plusieurs médicaments. C’est notamment le cas de traitements pour les maladies génétiques, mais les résultats obtenus sont mitigés.  Mais d’autres médicaments basés sur la thérapie génique sont en train d’arriver sur le marché, avec des certains cas de bons résultats, par exemple pour le traitement du cancer ou de certaines maladies rares de type immunologique, neurologique, infectiologique ou encore ophtalmologique.

Du génome à l’eugénisme ?

Si toutes ces avancées suscitent l’enthousiasme du fait de leur potentiel médical, elles suscitent aussi des interrogations et inquiétudes éthiques. Car si la modification d’un gène pour agir sur une maladie lourde est porteuse d’espoir, l’utilisation potentielle de cette expertise à des fins bien moins thérapeutiques, par exemple pour choisir des caractéristiques bien précises pour un embryon, inquiètent… même si dans les faits la recherche, et notamment celle portant sur les ciseaux CRISPR, est très strictement encadrée. 

Une autre source d’inquiétude ? La production possible d’organismes génétiquement modifiés à des fins nuisibles, par exemple dans un contexte terroriste, est aussi une menace potentielle. Et l’impact possible à long terme de modifications génétiques, et leur transmission possible de génération en génération est aussi une source importante de préoccupation. 

Last but not least : la protection des données privées est sans doute l’un des enjeux les plus urgents découlant du décryptage du génome. Avec en filigrane des questions fondamentales : 

Le génome décrypté pourrait donner des indications sur nos caractéristiques et sur le risque de développer certaines maladies. Mais qu’en est-il si ces données sont accessibles à un employeur, une compagnie d’assurances santé ou une autre organisation susceptible d’exploiter ces informations à nos dépens ? 
Où sont hébergées les milliards de données générées par le décryptage du génome, et en particulier de celles de volontaires à des fins de recherche ? La gestion potentielle de ces données par des acteurs privés, comme les GAFA, n’induit-elle pas de risques en termes de confidentialité ?

Pour en savoir plus sur la thérapie génique

Dossier info de l’Inserm
 
Etat des lieux et perspectives

Pour en savoir plus sur les enjeux éthiques liés au séquençage de l’ADN

Avis du Comité Consultatif National d’Ethique  pour les sciences de la vie et de la santé

Le point de vue de l’Inserm 

Big data et génome : pour aller plus loin

ADN des microbes et Big Data

La révolution du Big Data pour la recherche sant